#基因编辑#植物合成#生物基新材料#微生物
科|技|突|破
Science Breakthrough
Nature Genetics:突破克隆玉米关键抗旱基因|功能基因
PBJ:利用烟草低成本生产癌症免疫检查点抑制剂|植物合成
Nature:利用AI创造替代食物来源的新蛋白质|AI计算
Advanced Science :基于可解释深度超图学习模型的多肽二级结构预测|AI设计
NAR:面向生物序列功能分析的“一站式”深度学习计算平台|AI设计
大|企|业|动|向
Big Player
Indee Labs携手GenScript开发基于Hydropore的DNA敲除试剂盒
AI育种初创Canonic推出6款高活性成分大麻产品
香料巨头奇华顿收购Amyris化妆品成分
C16 Biosciences可持续棕榈油替代品平台推出植物替代油
ICRISAT携手Eagle Genomics开发基于AI的微生物组解决方案
Zeon投资Visolis高效生产生物基负碳化学品
BRAIN Biotech携手AMSilk开发高性能生物基蛋白质纤维
LanzaTech携手Tadweer探索废物转化替代燃料
Yield10 Bioscience开发耐除草剂山茶果关键技术

融|资|速|递
Funds & Funding
通用型生物育种平台博瑞迪获超亿元A2轮融资
基因编辑企业Elo Life Systems获2450万美元A轮融资
生物技术初创Spira获300万美元股权融资
生物基新材料企业Checkerspot获5500万美元C轮融资
AI蛋白质设计平台分子之心获超亿元战略融资
昆虫蛋白初创Future Fields获1120万美元种子轮融资
作物保护解决方案企业Robigo获685万美元种子轮融资
产 | 业 | 之 | 声
Community Voice
农业农村部:进一步扩大转基因玉米大豆产业化应用试点范围
01 科|技|突|破
Nature Genetics:突破克隆玉米关键抗旱基因|功能基因
干旱是威胁玉米高产、稳产的主要自然因素。鉴定玉米抗旱种质资源、解析其遗传基础,对玉米抗旱性的遗传改良和分子设计育种具有重要意义。中国农业大学团队研究利用三代PacBio长读长测序技术、HiC技术和光学图谱完成了玉米抗旱优异种质资源CIMBL55基因组的高质量组装和注释工作。研究发现,前期通过全基因组关联分析(GWAS)和干旱应答基因表达的数量性状位点解析(eQTL)确定的108个潜在的抗旱基因中,CIMBL55基因组中至少携带了65个抗旱基因的优异等位变异,推测这可能是构成其优良抗旱性的遗传基础。CIMBL55基因组的组装为解析玉米抗旱性的遗传变异、鉴定优异抗旱基因资源、克隆关键抗旱基因,提供了高质量的基因组信息。
原文链接:
https://doi.org/10.1038/s41588-023-01297-y
PBJ:利用烟草低成本生产癌症免疫检查点抑制剂|植物合成
与哺乳动物细胞平台相比,植物制造系统具有较低的初始投资、较低的培养成本、易于扩展生产、污染性低等优势,产生的蛋白质具有更均匀的糖基化特征。伦敦大学感染与免疫研究所团队研究探讨在工厂制造系统中生产免疫检查点抑制剂(ICI)的可行性,旨在使用工厂制造系统向更广泛的市场提供价格合理的ICI。ICIs Monalizumab、Nivolumab和 Relatimab使用植物表达系统MIDAS-P在本塞姆氏烟草和普通烟草中实现了成功瞬时表达。这种形式与在哺乳动物细胞中进行的临床使用或临床试验中的形式一致。ICI还以突变的IgG1形式表达,以提高纯化回收率并减少Fcγ受体结合。本研究确定了植物来源的ICI的蛋白质积累和恢复、配体结合特征、功能能力和制造成本。展示了使用基于IgG1的恒定区来提高纯化回收率并减少Fcγ受体结合。这将大大促进在使用工厂制造系统向更广泛的市场提供价格合理的ICI。
原文链接:
https://doi.org/10.1111/pbi.14034
Nature:利用AI创造替代食物来源的新蛋白质|AI计算
人工智能(AI)对食品生物分子杂性的作用,可以帮助设计可持续、低成本、优质的蛋白质来源以支持人类和地球的健康。研究人员将随机氨基酸序列输入到一个结构预测网络中,根据网络的预测使得该结构越来越像蛋白质。该团队描述了两种人工智能方法,能够将特定的序列或结构嵌入到新的蛋白质中,用这些方法设计了催化特殊反应的酶、能够与其它分子结合的蛋白质和可用于抗呼吸道病毒的疫苗中的蛋白质。该研究旨在创建一个关于食品生化成分和功能的公共数据库,揭示AI可以用来设计新的蛋白质作为替代食物来源。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/d41586-022-02947-7
Advanced Science :基于可解释深度超图学习模型的多肽二级结构预测|AI设计
目前已经有很多方法被设计用于蛋白质结构预测,由于肽和蛋白质之间的固有结构差异其不能够完全适用于二级结构预测。山东大学联合俄亥俄州立大学课题组研究了一种用于预测肽二级结构和探索下游任务的深度图学习框架PHAT。该框架包括一个新的可解释的深度超图多头注意力网络,该网络使用基于残差的推理进行结构预测。此算法可以结合来自大规模生物语料库的序列语义信息和来自多尺度结构分割的结构语义信息,即使使用极短的肽,也可以获得更好的准确性和可解释性。该研究进一步证明了二级结构在肽三级结构重建和下游功能分析中的重要性,突出了模型的多功能性。
原文链接:
https://doi.org/10.1002/advs.202206151
NAR:面向生物序列功能分析的“一站式”深度学习计算平台|AI设计
新一代测序技术的发展使得生物序列数据量呈指数增长,由于传统的湿实验方法费力、耗时且成本高,数据驱动的机器学习策略在近些年已经成为序列功能分析有效的解决方案之一。电子科技大学联合山东大学构建了首个生物序列功能分析的深度学习计算平台 DeepBIO,该平台主要面向生物学家或者没有编程基础的研究者们提供“一站式”计算服务,给定任意的生物序列数据,平台总共支持42种深度学习算法全自动建模训练、比较、优化等流程,以及提供全面的结果可视化分析,涵盖数据集分析,模型性能比较、可解释性、特征分析、序列功能区域发现等。
原文链接:
https://doi.org/10.1093/nar/gkad055
02 大|企|业|动|向
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基因编辑
Indee Labs携手GenScript开发基于Hydropore的DNA敲除试剂盒
开发Hydropore的生物技术初创Indee Labs与基因合成技术平台GenScript合作旨在为Hydropore™开发一个DNA敲除试剂盒,以实现AAV超过5kb限制的大型转基因插入物。Indee Labs将以更高的效率将GenScript的非病毒DNA有效载荷输送到细胞中,并能够集成比传统病毒方法允许的更长的DNA插入物。同时GenScript正在为直接DNA插入提供各种单链和双链结构;Indee Labs的团队正在优化Hydropore™协议,并评估用Hydropore™和电穿孔处理的T细胞之间的功能差异。Indee Labs通过简单的工作流程、商业GMP级缓冲区和较小的占地面积,可以进行改进的免疫细胞研究和开发,提高产量和功能。GenScript是全球生物技术集团,基于其领先的基因合成技术开发了四个主要平台:全球细胞治疗平台、生物制剂CDMO平台、CRO平台和工业合成产品平台。
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AI育种
AI育种初创Canonic推出6款高活性成分大麻产品
以色列AI育种初创Canonic推出6种第二代混合大麻产品,六种新产品名为Synergy(THC 24%)、Combo(THC 24%)、Mosaic(THC 23%)、Two Stars(THC 24.2%)、Mash Kush(THC 24.4%)、Blend Kush(THC 23.8%)。其特点是四氢大麻酚(THC)含量高,在23%及以上(以色列允许的最高THC百分比为24.4%)。Canonic是Evogene的全资子公司,利用Evogene专有的GeneRator AI引擎开发医用大麻产品。通过精确的植物表征能力和先进的计算分析,该公司显著加速了传统上需数十年的育种过程,战略包括开发活性化合物和遗传稳定性改良的大麻品种以实现特定的医疗效果,并将其推向市场,以独立或通过合作的方式将医用大麻产品商业化。
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合成生物
香料巨头奇华顿收购Amyris化妆品成分
全球领先的香精香料供应商奇华顿宣布与合成生物学企业Amyris达成长期合作协议。奇华顿收购Amyris的部分化妆品原料,包括其中包括Neossance Squalane润肤剂,一种植物基硅酮替代品Neossance Hemisqualane,以及可持续的防晒成分CleanScreen。其中Neossance Squalane是Amyris使用甘蔗生产的角鲨烷,用以替代从深海鲨鱼肝脏中获取的角鲨烷。根据协议,Amyris将继续为奇华顿生产用于化妆品的成分并提供创新能力,作为回报,奇华顿将成为Amyris未来可持续美容成分的商业化合作伙伴。
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微生物
C16 Biosciences可持续棕榈油替代品平台推出植物替代油
C16 Biosciences的可持续棕榈油替代品平台Palmless正在推出首款可供购买的产品“Save the F#$%ing Rainforest”滋养油。该滋养油具有Palmless标志性成分:以微生物酵母为底盘通过生物设计的Palmless Torula油,该产品旨在推进公司在开发可持续、可追溯和稳定的棕榈油和棕榈衍生成分替代品,以帮助解决工业、农业棕榈油造成的更大的可持续性问题。经美国农业部认证,该植物替代油生物成分为独特的类胡萝卜素——包括β胡萝卜素和托鲁烯以及仅在真菌中发现的固醇,这些抗氧化剂将助力促进皮肤屏障功能和保持皮肤发光。其独特的生物制造工艺可以隔离农业杂质,并解锁美护等多用途平台。
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微生物
ICRISAT携手Eagle Genomics开发基于AI的微生物组解决方案
国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)和Eagle Genomics在改造旱地的创新国际会议上签署新的合作框架。双方将基于生命科学和数据科学交叉学科合作,开发微生物解决方案,以帮助解决全球粮食安全、营养和农业方面的挑战。e[datascientist]™是一个由网络科学和多层超图驱动的平台,应用机器学习和人工智能来提供数据驱动以解决复杂问题,改善植物营养密度,并增加数据驱动的健康和人类健康结果。该平台集成了微生物组创新技术,从描述和描述微生物群落,到更好地了解复杂的因果机制,再到阐明宿主-微生物群落相互作用。Eagle Genomics正在通过弥合“翻译差距”来重塑生命科学的研究和开发,使来自一系列不同来源和数据集的科学知识能够通过e[datascientist]™平台进行集成和分析,以创建新的假设,并提供强大的、有科学基础的实用解决方案。
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生物基新材料
Zeon投资Visolis高效生产生物基负碳化学品
Zeon Corporation(日本瑞翁株式会社)宣布,通过其Corporate Venturing子公司Zeon Ventures投资了一家合成生物学公司Visolis,Zeon将与Visolis密切合作,帮助加速公司可持续生物制造工艺的开发,为从化妆品到汽车的一系列应用提供具有成本竞争力的生物基负碳化学品。Visolis正在开发一个结合人工智能、合成生物学和传统化学催化的生物制造平台,以高效生产一系列负碳化学品。Visolis 的专有工艺将可持续原材料转化为生物基化学品,其应用范围从个人护理的活性成分到大宗石化产品的直接替代品,其可以将产品的生产工艺成本降低20-50%。Zeon Corporation是日本第一家将合成橡胶产业化的日本公司,主要业务分为3大模块:弹性体业务(合成橡胶、合成胶乳和化学品)、高性能材料业务(化学品、信息材料和专用树脂)、其他业务(RIM配方、RIM产品、医疗设备和技术转让等)。
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生物基新材料
BRAIN Biotech携手AMSilk开发高性能生物基蛋白质纤维
生物制造解决商BRAIN Biotech携手首个创新生物材料供应商AMSilk,利用BRAIN的生物技术专业知识推动高性能纤维材料的开发,将其蛋白质技术平台扩展到进一步的市场和应用阶段。双方将进一步优化结构蛋白的特定性能,AMSilk生产基于可再生碳结构蛋白的生物技术材料,这些蛋白质不仅完全可回收,而且100%可生物降解,不含微塑料,并具有卓越的机械和生化性能,广泛应用于服装、医疗和汽车行业等。
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碳捕获
LanzaTech携手Tadweer探索废物转化替代燃料
LanzaTech与Tadweer开展将废物转化为替代燃料的合作,探索开发大型转换工厂,将固体城市废物转化为可持续替代燃料的商业机会。该合作将进一步推动了美国和阿联酋加速清洁能源伙伴关系(PACE),并为深化循环经济和低碳燃料方面的合作奠定了基础。LanzaTech是一家创新的碳捕获和转化(CCT)公司,将废碳转化为可持续燃料、织物、包装和其他产品等材料,Tadweer是负责开发废物管理服务的企业。
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作物保护
Yield10 Bioscience开发耐除草剂山茶花关键技术
Yield10 Bioscience开发了耐除草剂(HT)山茶花关键技术,以控制山茶花杂草,并支持种植者将这种作物用于生物燃料原料油市场。2022年一季度,Yield10首次证明其HT春季Camellina系列耐受常用的阔叶除草剂,并于2022/2023年秋季,Yield10在美国南部的田间试验中重新测试了其领先的商业候选产品HT春季Camellina系列,并复制了成功结果。这些HT春季Camellina系列也适用于杂草控制产品的应用。预计该公司领先的商用HT春季Camellina生产线的进一步种子扩大和现场测试将在2023年继续进行。同时Yield10已于2022年向美国农业部-APHIS生物技术监管服务公司(BRS)根据安全规则对除草剂耐药山茶花进行监管状态审查(RSR),结果正在正在等待机构回复。
03 融|资|速|递
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基因编辑
通用型生物育种平台博瑞迪获超亿元A2轮融资
通用型生物育种平台石家庄博瑞迪生物技术有限公司获A2轮超亿元融资,本轮融资由阿里巴巴领投,昊辰资本等跟投,万物资本、吉慧资本和允治资本跟投,川行资本担任财务顾问。资金主要用于国内及海外业务拓展、生物育种智慧实验室研发、基因编辑、快速育种平台搭建等工作。博瑞迪专注于动植物分子育种技术的创新与应用,自主构建了一整套完全国产化、标准化、自动化、信息化的分子育种技术体系。未来公司将更加着眼于育种技术的串联和效率提升,秉承“助推分子育种 造福现代农业”的使命,助推我国动植物生物育种产业化跨越式发展。
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基因编辑
基因编辑企业Elo Life Systems获 2450万美元A轮融资
基因编辑企业Elo Life Systems获2450万美元A轮融资,本次融资由AccelR8、Novo Holdings和DCVC Bio等投资者领投,资金用于抗病香蕉的田间试验,此外,该公司也在利用罗汉果遗传信息进行生物工程改造的植物开发一种新的天然甜味剂,计划于2025年进入市场。公司预计将在今年下半年启动B轮融资,以进一步扩大甜味剂的规模和研发渠道。Elo Life Systems专注于利用基因技术在食品和农业领域开展工作。
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生物基新材料
生物技术初创Spira获300万美元股权融资
生物技术初创Spira获得300万美元股权融资,资金将用于扩大其覆盖范围,并将其产品推向化妆品等更广泛的市场。Spira是一家生物技术初创公司,致力于将采掘业转变为再生行业,旨在为使用藻类的人造色素提供健康和可持续的天然色素替代品。公司拥有83个农场网络,每月可生产400多吨藻类,目前涵盖六种产品,广泛应用于食品、化妆品和纺织等行业。公司的目标是提供所有原生天然颜色的产品,以取代石化颜料,同时将与全球农场网络合作,以便为人类和地球采购健康材料,以重塑供应链。
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生物基新材料
生物基新材料企业Checkerspot获5500万美元C轮融资
生物基新材料企业Checkerspot获得5500万美元C轮融资,本轮融资由ArrowMark Partners领投,Cox Enterprises及其他投资者跟投,资金将加速Checkerspot技术开发和高性能、基于生物的日常产品替代品的商业化应用。Checkerspot专注于开发高性能生物基材料成分,其消费品牌WNDR® Alpine采用生物基材料,由Checkerspot的微藻类衍生油制成,这些油被配制成聚氨酯泡沫和铸造聚氨酯,满足不同产品的特定性能指标。广泛应用于工业应用、个人护理以及食品营养等方面,减少全球对化石燃料的依赖,技术产品创新及商业化需求。
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AI设计
AI蛋白质设计平台分子之心获超亿元战略融资
AI蛋白质设计平台公司分子之心获得超亿元战略融资,本轮融资由合成生物学龙头凯赛生物领投,联想创投跟投,天使轮领投方红杉中国追加投资。本轮资金将用于AI蛋白质优化与设计平台MoleculeOS进一步开发,以及在大分子药物设计、合成生物学等产业领域的应用探索。获得凯赛生物战投后,双方还将联合推动合成生物学产线升级和新品研发。分子之心基于团队多年AI蛋白质结构预测与设计的经验,自主研发了国内首个功能完整的AI驱动的蛋白质预测和设计平台MoleculeOS,运用数据驱动的AI方法,快速识别、改造甚至从头设计最合适的蛋白质,从而颠覆大分子药物设计、合成生物学、环境保护等领域研发范式。
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昆虫蛋白
昆虫蛋白初创Future Fields获1120万美元种子轮融资
加拿大昆虫蛋白初创Future Fields获得1120万美元种子轮融资,本轮投资由Bee Partners、丰田风险投资公司、Builders VC、AgFunder、Amplify Capital、BoxOne Ventures、Green Circle Foodtech、Siddhi Capital和Climate Capita等投资,资金将用于设施及人员建设,同时在10000平方英尺的制造空间内生产千克规模的重组蛋白质,以扩大果蝇作为高价值重组蛋白质的生产工具。酵母和大肠杆菌等工程微生物一直是重组蛋白质表达的主力,但精密发酵存在资本密集型、能源密集型及操作成本高昂等障碍。Future Fields通过果蝇表达的蛋白质基因带到胚胎阶段,将其插入基因组。当果蝇长大后,它会从细胞中分泌蛋白质(繁殖昆虫系以积累种群)。在寿命接近尾声时,收获果蝇由此产生的蛋白质并加以纯化。该技术手段除了降低生产成本和降低环境碳足迹外,果蝇相比细菌或酵母细胞的设备更容易来促进复杂的蛋白质生产。
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作物保护
作物保护解决方案企业Robigo获685万美元种子轮融资
作物保护解决方案企业Robigo获得685万美元种子轮融资,本轮融资由Congruent Ventures领投,Good Growth Capital、、First Star Ventures等跟投。根据实验室植物数据,Robigo将利用该投资证明多种作物的疾病减少了90%以上,以证明户外野外环境中的产品功效。Robigo是一家生物制造公司,开发一种微生物平台技术,其可扩展平台技术运用了生物工程和数据科学方面的深厚专业知识,利用生物工程和数据科学来精确保护作物免受疾病侵袭,同时对有益的微生物、授粉者、人类和环境安全。公司最初专注于开发技术以解决影响高价值特种作物疾病,而这些作物几乎没有有效的商业治疗方法。
04 产|业|之|声
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转基因
农业农村部:进一步扩大转基因玉米大豆产业化应用试点范围
农业农村部发布关于落实党中央国务院2023年全面推进乡村振兴重点工作部署的实施意见,提出加快推进农业关键核心技术攻关,深入实施种业振兴行动。主要包括加快资源普查,推进育种创新,全面实施农业生物育种重大项目;加快生物育种产业化步伐,进一步扩大转基因玉米大豆产业化应用试点范围;加快推进农业关键核心技术攻关,强化政策扶持,组织跨学科跨领域科研力量联合攻关;推进科技创新,完善创新体系,推进国家现代农业产业科技创新中心、农业科技创新联盟建设,加快培育农业科技引领型企业;改善创新条件,加快技术应用。
趋|势|报|告
-全球视野下分析植物基因编辑行业的现状和趋势
-大企业及资本等创新力量拥抱下的产业爆发
-国内外初创公司选品逻辑
-国内外商业化路径鉴定:“T”型战略、“4E”模型
-中国产品研发上市流程及卡脖子技术突破
知耕团队基于新兴科技行业研究模型,制作了植物基因编辑育种创新图谱,期待促进源头创新与产业深度融合,为科学家、创业者、投资⼈及相关⽅同⾏,提供商业化技术创新平台交流机会。
■ 了解更多生物科技领域前沿趋势报告
基因编辑食品监管与标识管理研究
http://cohd.cau.edu.cn/module/download/downfile.jsp?classid=0&filename=afa250a04861446fb70b30b44d83c45e.pdf
植物抗病性与病害绿色防控:主要科学问题及未来研究方向
https://www.nsfc.gov.cn/csc/20345/20348/pdf/2020/202004-381-392.pdf
合成生物学十大未来挑战
https://www.ssbt.org.cn/upload/20220309144833_708.pdf
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知耕智汇94期 | Namuh携手Ginkgo开发功能性低聚糖;Enko获8千万美元C系列融资;FDA拒绝CBD为膳食补充剂申请
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