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知耕智汇55期 | 绿色合成化学农药;培养肉植物性支架;碳捕获企业Climeworks获6.5 亿美元融资;习近平考察崖州湾种子实验室
栏目:知耕智汇
日期:2022-12-08
浏览量:758
摘要:

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快报摘要 - Wrap Up


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科|技|突|破  

Science Breakthrough

Genome Biology:利用FnCas9非靶标切割特异性扩大PE编辑范围|基因编辑

PBJ:植物蛋白质点突变功能效应的机器学习工具PPVED|AI设计

Nature Communication:利用合成生物学策略实现绿色合成化学农药|合成生物

Metabolic Engineer:利用代谢工程育种培育托品烷生物碱高产且抗除草剂的颠茄转基因纯系|生物育种

BioRxiv:Facebook使用AlphaFold2预测12M蛋白质结构|AI设计

BCB:无细胞合成生物学:下一代合成生物学的新兴监管挑战|合成生物

Trends Biotechnol:合成生物学驱动的功能性饲料资源定制|合成生物

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大|企|业|动|向  

Big Player

凯赛生物推动秸秆乳酸产业化

荃银高科与隆平高科就植物新品种权纠纷发布公告

安琪集团酵母蛋白年产量冲刺万吨

ADM将投资约3亿美元扩大替代蛋白产能

以色列研究人员开发出用于培养肉的植物性支架

Corteva Agriscience在欧洲开设了首个种子应用技术中心

Benson Hill与Kellogg旗下公司在替代肉领域达成合作

谷歌、Stripe、Shopify加入9.25亿美元碳捕获计划

Codexis和Molecular Assemblies合作开发专有的高性能DNA聚合酶

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融|资|速|递

Funds & Funding

碳捕获企业Climeworks获6.5亿美元股权融资

酶促DNA合成企业Ansa获 6800万美元A轮融资

植物肉公司Haofood获350万美元种子轮融资

植物遗传技术企业Core Biogenesis获1000万欧元A 轮融资

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产 | 业 | 之 | 声

Community Voice

美国植物性食品市场规模达74亿美元

习近平实地调研考察崖州湾种子实验室并作出重要指示

农发行提供1000亿元支持种业振兴

欧盟授权四种转基因作物用作食品和动物饲料

英国成为第一个将CBD产品作为食品监管的国家


01 科|技|突|破

Genome Biology:利用FnCas9非靶标切割特异性扩大PE编辑范围|基因编辑

PE编辑技术可以诱导各种类型的突变,但基于 SpCas9的PE编辑技术只能对靶标DNA上PAM序列(NGG)上游3 bp内的碱基进行编辑,存在脱靶问题。2022年4月11日,研究团队于Genome Biology杂志发表研究,该研究使用一种新的方法改进了基于SpCas9(H840A)的PE编辑系统,即使用本研究中开发的FnCas9(H969A)连接逆转录酶RT,可以在之前SpCas9未能编辑的范围内进行精准的基因组编辑,使得SpCas9(H840A)引导的PE编辑系统的PAM限制得到了极大的扩展。研究数据表明,通过使用RHA-FnCas9(H969A)-RT可以覆盖之前已知致病突变的很大一部分(85.51%)。

原文链接:

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02644-8


PBJ:植物蛋白质点突变功能效应的机器学习工具PPVED|AI设计

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蛋白质点突变也被称作单氨基酸替换(SAAS)可影响蛋白质行使正常的功能。传统的分子实验能准确衡量SAAS对植物蛋白质功能的影响,然而这些实验的开展非常耗时耗力且操作困难。2022年4月10日,四川农业大学玉米研究所卢艳丽教授团队于Plant Biotechnology Journal发表研究,该研究论文开发了一个机器学习工具PPVED,实现了植物蛋白质点突变功能效应的准确预测,极大地促进了植物功能性遗传变异的识别与挖掘

原文链接:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.13823


Nature Communication:利用合成生物学策略实现绿色合成化学农药|合成生物

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草甘膦除草剂使用广泛,但由于其商业化生产过程涉及到诸多有毒的化合物、试剂和废物,我国对其监管执法严格,导致该农药的价格持续上升。因此绿色合成草甘膦需求迫切。近期,福建农林大学生命科学学院高江涛课题组在Nature Communications发表研究,课题组利用合成生物学策略成功实现农药草甘膦的绿色合成。研究团队利用基因组挖掘技术从链霉菌NRRL B-24309培养粗提物中分离出两种膦酸类小分子抗生素,两种化合物均由氨基甲基膦酸盐(AMP)与非标准氨基酸N5-羟基精氨酸形成肽键,而氨基甲基膦酸盐(AMP)可以成为合成草甘膦的前体小分子。并开发了一种将AMP转化为草甘膦的高效实用的化学工艺。

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41467-022-29188-6


Metabolic Engineer:利用代谢工程育种培育托品烷生物碱高产且抗除草剂的颠茄转基因纯系|生物育种

颠茄是我国栽培面积最大的用于生产TA的商业药材,但颠茄中TA含量低,导致药物生产成本高昂。因此,培育TA高产且抗除草剂颠茄能够降低TA药物生产成本。近日,西南大学生命科学学院廖志华教授团队于Metabolic Engineering发表研究,该研究首次发现钙调蛋白AbCaM1能正调控药用托品烷生物碱(TA)生物合成,并首次建立了以草甘膦为直接筛选压的颠茄高效转基因技术;利用AbCaM1和G2-EPSPS基因,培育出莨菪碱和东莨菪碱高产且抗除草剂的颠茄转基因纯系;大田试验表明颠茄转基因纯系具有很强的抗除草剂能力,且颠茄叶片中莨菪碱含量高达10.61 mg/g DW。该研究利用抗除草剂基因G2-EPSPS作为唯一标记基因,以草甘膦为直接筛选压力,建立了培育抗除草剂颠茄的关键技术。

原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.ymben.2022.03.014


BioRxiv:Facebook使用AlphaFold2 预测12M蛋白质结构|AI设计

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蛋白质设计一直依赖于结构功能与蛋白序列的对应关系,从骨架原子坐标逆向预测蛋白质序列是亟待解决的问题。2022年4月10日,加州大学伯克利分校和 Facebook 人工智能团队的研究人员于BioRxiv发表研究,通过使用 AlphaFold2预测12M蛋白质序列的结构,将训练数据增加了近三个数量级。使用这些额外数据进行训练,具有不变几何输入处理层的序列到序列转换器在结构上保持的主干上实现了51%的本地序列恢复,对于掩埋残基的恢复率为72%,总体上比现有方法提高了近10个百分点 。该模型可推广完成各种更复杂的任务,包括蛋白质复合物的设计、部分掩蔽结构、结合界面和多种状态。

原文链接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.04.10.487779v1


BCB:无细胞合成生物学:下一代合成生物学的新兴监管挑战|合成生物

无细胞合成生物学具有巨大的应用潜力,然而这一愿景也对全球生物安全和生物安保产生了影响。加拿大的科研人员2021年9月在Biochemistry and Cell Biology发表综述,探讨了无细胞合成生物学的应用潜力及其相关的监管挑战。建议从经济、生物安全和生物安保的视角充分利用无细胞合成生物学、制定适当的政策和法规,防范下一次疾病大流行并及时采取必要的缓解措施。

原文链接:

https://www.ssbt.org.cn/upload/20220318104246_639.pdf


Trends Biotechnol:合成生物学驱动的功能性饲料资源定制|合成生物

为不断提供功能性饲料资源(FFRs)以满足快速增长的肉类需求,需要一种替代传统养殖的高效工艺。近日,研究人员于Trends Biotechnol发表研究,探讨了合成微生物发酵作为一种新兴的解决方案,需要协调微生物定制,产品加工,动物实验效果评价。利用合成生物学生产高牛磺酸,可以用于动物饲料等领域。合成生物驱动的定制的功能性饲料资源将有利于肉类生产。为了达到发酵功能性饲料资源的最大功效,需要不断优化功能性饲料资源中活性植物天然产品的数量和形式,单细胞蛋白的营养结构,效应导向的饲料策略。迭代优化循环将以效果评价为指导,以人工合成微生物为驱动,并以设计的产品加工为促进。


02 大|企|业|动|向

凯赛生物推动秸秆乳酸产业化

2022年4月12日,凯赛生物2021年年报业绩说明会中,董事长刘修才表示公司在系统研究生物废弃物作为生物制造原料的产业化技术,目前用秸秆做乳酸的中试结果证明,这个研究实现产业化无论是技术还是成本都具有可行性。这项技术将对保障合成生物大规模产业化原料来源,并且具有竞争力,对于合成生物学产业碳排放推动都具有里程碑意义。作为全球领先的生物制造新材料企业,凯赛生物于2003年实现生物法长链二元酸的产业化,是目前全球具有代表性的、以合成生物学和生物制造为技术基础的平台型企业。


荃银高科与隆平高科就植物新品种权纠纷发布公告

2022年4月12日晚,荃银高科发布公告称,此前因与隆平高科存在侵害植物新品种权纠纷,公司去年7月已向合肥市中级人民法院提起诉讼,为进一步维护公司及股东的合法权益,公司向合肥中院递交了《变更诉讼请求申请书》,将赔偿额5000万元调整为3亿元。据悉,双方的诉讼焦点在于荃银高科认为,“五山丝苗”种子是授权给隆平高科的,从未授权给湖南隆平。但是隆平高科认为,湖南隆平对“五山丝苗”水稻品种许可使用权,源于母公司隆平高科的直接授权,隆平高科授权的在先权利依据,系与荃银高科签订的《使用水稻常规品种“五山丝苗”配组协议》。


安琪集团酵母蛋白年产量冲刺万吨

近日,据媒体报道安琪集团酵母蛋白年产量预计今年将突破1万吨。去年,其酵母蛋白年产量5000吨左右。近年来,安琪集团加大产学研合作,与江南大学、北京工商大学、中国海洋大学、三峡大学建立项目合作,向优质酵母蛋白发起技术攻关。目前,安琪集团已开发出蛋白质含量大于80%的酵母蛋白产品。作为宜昌城市未来场景实验室,安琪功能性菌体蛋白未来场景实验室正式对外发布。据介绍,该实验室将在深度利用酵母蛋白、细胞培养肉研究等方面开展技术攻关。


ADM将投资约3亿美元扩大替代蛋白产能

2022年4月12日,ADM宣布随着公司继续增加产能以满足强劲的需求增长,它将投资约3亿美元,大幅扩大其位于伊利诺伊州Decatur的替代蛋白生产。ADM公司将通过在Decatur开设一个新的、最先进的蛋白质创新中心,进一步提高其替代蛋白质的能力。蛋白质创新中心将进一步扩大ADM公司位于迪凯特的尖端创新综合体,加入公司的食品应用中心和动物营养技术中心,并增强公司与客户密切合作的能力,以开发满足其需求的定制解决方案。


以色列研究人员开发出用于培养肉的植物性支架

近日,以色列理工学院研究人员已经开发出用于种植培养肉的植物性支架。据报道,组织工程特别是培养肉的组织工程,涉及寻找适合支架的细胞和模仿复杂自然组织所需的制造技术。工程师们使用豌豆和大豆蛋白分离物与改性海藻酸盐的混合物,作为生长肌肉组织的普通动物源性支架剂的替代品。用这些材料构建的支架显示出高度的稳定性和刚度,同时允许牛的细胞扩散,培养的肉将从这些细胞中发育出来。研究人员随后用包括植物混合物的生物墨水对支架进行3D打印,在打印前将牛细胞添加到混合物中,或在打印后将牛细胞播种到支架上。研究人员指出,由于支架的几何形状可以控制,营养物质的进入和发展中的组织的碎片的清除都可以被调节。这项技术可能会在未来实现大规模的培养肉的快速生产。


Corteva Agriscience 在欧洲开设了首个种子应用技术中心

近日,Corteva Agriscience 在法国西南部开设了一个新的种子应用技术中心 (CSAT),其目标是帮助欧洲的农民让他们的作物获得最佳开端并获得成功的收成。CSAT将专注于服务开发,并通过强大的科学投资将成为新的种子处理解决方案的一部分,以帮助农民应对不断变化的农业部门的挑战。种子处理可以保护幼苗免受害虫和疾病的侵害,并帮助幼苗茁壮成长,从而提高生产力。CSAT充当实验室、测试中心和种子处理厂,为种子应用技术的发现、制定和实际测试制定了严格的流程。这一过程使种子处理能够保护并解决农场挑战,为种植者创造价值。CSAT还将与商业合作者合作,提供服务和测试,以帮助提高种子处理的质量。


Benson Hill与Kellogg旗下公司在替代肉领域达成合作

近日,作物遗传学公司Benson Hill与家乐氏旗下MorningStar Farms达成合作伙伴关系,为后者提供用于替代肉类产品的大豆成分。该交易的财务条款未披露。MorningStar Farms 将把 Benson Hill 的超高蛋白大豆纳入其植物肉系列,目前包括牛肉汉堡、鸡肉和早餐肉类似物。Benson Hill开发了具有更高营养成分的选择性育种大豆。该公司表示,与普通大豆相比超高蛋白大豆所含的蛋白质含量要高出20%。从理论上讲,这意味着每英亩需要更多的蛋白质,需要更少的投入,例如杀虫剂和人力时间。通过简化和消除大豆加工中的某些步骤,Benson Hill 表示与传统品种相比,其大豆的用水量减少了70%,二氧化碳排放量减少了50%。 


谷歌、Stripe、Shopify加入9.25亿美元碳捕获计划

2022年4月13日,Facebook和谷歌的母公司已经加入了一项价值近10亿美元的计划,该计划旨在通过承诺购买开发出来的碳捕获技术来应对气候变化。Meta和Alphabet周二表示,他们已加入支付处理商Stripe的子公司Frontier,承诺支出最终将流向获批的碳捕获项目。电子商务公司Shopify和咨询公司麦肯锡也加入了Frontier计划。Frontier在确定值得投资的技术时将考虑持久性、物理足迹、成本(和可扩展性)、容量和环境友好等五个因素。Frontier将作为金融服务公司Stripe的子公司运营,还将由通过Stripe Climate购买碳去除的企业提供资金。科技巨头已经寻求通过购买可再生能源和其他努力来减少碳足迹。


Codexis和Molecular Assemblies合作开发专有的高性能DNA聚合酶

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2022 年 4 月 12 日,合成生物酶技术上市公司Codexis 与 Molecular Assemblies宣布双方在酶促 DNA 合成上用酶设计的最新进展:通过使用Codexis所开发的高度进化的DNA聚合酶,实现了全酶合成技术(FES)。该项技术的基础DNA聚合酶,也正是上述关键的末端脱氧核苷酸转移酶(TdT),为了能够在酶促DNA合成市场中获得差异化竞争的能力,Molecular Assemblies在2020年便开始与Codexis合作开发高性能的TdT。


03 融|资|速|递

碳捕获企业Climeworks获6.5亿美元股权融资

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近日,以直接空气捕获为减碳技术的公司Climeworks筹集了 6.5 亿美元股权融资,由Partners Group和GIC共同牵头,此次融资是碳捕获公司有史以来募集到的最大金额。Climeworks创立于2009年,致力于研发DAC+S,公司创立以来共获得将近8亿美元融资,而最近的这笔融资将开启公司下一阶段的增长,将DAC的产能扩大到数百万吨。


酶促 DNA 合成企业Ansa获 6800万美元 A 轮融资

2022 年 4 月 11 日,酶促DNA合成技术公司Ansa Biotechnologies正式宣布,其已完成了超额认购的6800万美元A 轮融资。本轮融资由Northpond Ventures领投,新投资者RA Capital、Blue Water Life Science Advisors、Altitude Life Science Ventures、Fiscus Ventures、PEAK6 Strategic Capital、Carbon Silicon Ventures 和 Codon Capital跟投,老股东Mubadala Capital、Humboldt Fund、Fifty Years 和 Horizons Ventures继续追加投资。此次融资所得资金将用于加速其下一代酶促DNA合成技术的开发,构建高通量合成仪器,并推出DNA合成服务。Ansa Biotechnologies是加州大学伯克利分校的衍生公司,公司的核心技术建立在联合创始人Daniel Lin-Arlow和Sebastian Palluk所开发的从头酶促DNA合成方法之上。


植物肉公司Haofood获350万美元种子轮融资

2022年4月12日,使用花生蛋白生产植物基鸡肉公司Haofood宣布其已在种子轮融资中募得350万美元,本轮融资的共同投资人为Monde Nissin首席执行官Henry Soesanto、Rich Products Ventures和Big Idea Ventures。资金将用于加速实现其多元化其渠道销售战略和推进其研发基础设施建设。Haofood于2020年首次推出花生蛋白鸡肉产品,并与多家餐厅合作。其专业团队开发出专有技术Innotein,用花生和其他植物蛋白制作出各种具有独特质地和鲜味的植物鸡肉。同时Haofood希望进入亚洲和其他地区不断增长的植物基食品市场,为了推进研发活动,将对其现有的生产设施进行重大扩建。


植物遗传技术企业Core Biogenesis获1000 万欧元A 轮融资

近日,法国初创公司Core Biogenesis获得了由Blue Horizon领投的1000万欧元A轮融资。该公司表示将利用这笔资金进一步开发其专有平台并扩大团队,以扩大其位于法国斯特拉斯堡的第一家生物分子生产工厂规模。Core Biogenesis由Chouaib Meziadi博士和Alexandre Reeber于2020年5月创立,该公司主要利用植物作为生物工厂,生产细胞生长因子,应用于神经退行性疾病或癌症的细胞治疗以及培养蛋白的开发。基于在植物遗传学、表观遗传学和植物防御机制方面十年的研究,Core Biogenesis利用亚麻荠开发了其专有平台—— Ultra-scalable Bioproduction-as-a-Service(UBaaS),可以提高重组蛋白的产量及提取效率。



04 产|业|之|声

美国植物性食品市场规模达74亿美元

植物性产品是全国杂货零售商品销售增长的重要因素之一,是整体食品销售增长速度的三倍。近日,由 GFI授权的SPINS零售数据和PBFA的研究表明,美国代替动物产品的植物性食品的销售额在过去一年增长了6%,过去三年增长了54%,达到74亿美元。本数据覆盖了植物性食品市场作为一个整体和关键的植物性类别如肉类和牛奶,数据表明植物性食品是零售食品增长的关键驱动力。


习近平实地调研考察崖州湾种子实验室并作出重要指示

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今年中央一号文件明确提出,要推进种业领域国家重大创新平台建设。由此,今年的种业国家实验室创建,进入顶层设计和高位部署的战略机遇期,深受行业各界瞩目。2022年4月10日下午,习近平总书记实地考察调研崖州湾种子实验室,并作出重要指示,要求用自己的手攥紧中国种子,端稳中国饭碗,实现粮食安全。预计种业领域国家实验室将加快提速。崖州湾种子实验室是三亚崖州湾科技城搭建的公共科研平台,告别了曾经各个科研机构、高校的“各自为战”,南繁育种科研在这里实现了联合攻关,南繁产业集群发展的效应逐渐凸显。


农发行提供1000亿元支持种业振兴

2022年4月6日,据报道农发行面向全系统发出《关于争当金融服务种业振兴主力军的实施意见》,明确“十四五”期间,累计安排不低于1000亿元投贷联动资金,为现代种业高质量发展提供长期稳定的金融服务。意见强调,要扩大金融服务种业振兴覆盖面,加大对种业振兴重点领域的支持力度。一是支持种业科技创新。二是支持提升种业核心竞争力,支持培育具有差异化竞争优势、拥有核心竞争力的种业企业。三是支持筑牢种业根基。意见明确,要充分发挥政策性金融在服务种业振兴方面的示范引领作用,加大优惠政策力度,实行差别化信贷政策,创新运用“龙头企业带动+种业科技成果应用”等融资模式,发挥投贷联动效应,加大对种业优质客户的金融支持力度。


欧盟授权四种转基因作物用作食品和动物饲料

近日,欧盟委员会已授权三种转基因作物——一种大豆、一种油菜和一种棉花,并更新了一种用于食品和动物饲料的转基因棉花作物的授权。所有这些转基因作物都经过了全面而严格的授权程序,包括欧洲食品安全局(EFSA)的良好科学评估。授权决定不涉及种植,仅涉及上述转基因作物的进口。会员国在常设委员会和随后的上诉委员会中均未达到支持或反对的特定多数。因此,欧盟委员会有法律义务继续授权。授权有效期为 10 年,由这些转基因生产的任何产品都将受到欧盟严格的标签和可追溯性规则的约束。


英国成为第一个将 CBD 产品作为食品监管的国家

近日,英国公布成为世界上第一个规范公开销售口服合法大麻素的国家。总部位于英国的贸易集团大麻素产业协会(ACI)的创始人史蒂夫·摩尔表示,此举将为投资者“降低”大麻二酚(CBD)的风险,并刺激该领域的创新。该清单由英国监管机构食品标准局(FSA) 与 ACI 合作编制,包含约 3,500 种含有CBD的产品,这些产品已获准在英国组成国家上市。同时,摩尔在CBD清单发布活动上表示,监管框架的实施将为生产商、零售商、消费者和投资者“降低” CBD 的风险。




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